RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
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SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.61■□□□□ 0.89
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.61■□□□□ 0.89
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SUMO3-201ENST00000332859 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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SUMO3-201ENST00000332859 PALM2Q8IXS6 379 aa20.6■□□□□ 0.89
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