RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 GPSM1Q86YR5 675 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SYT12Q8IV01 421 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 NRSN1Q8IZ57 195 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PMEPA1Q969W9 287 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 OSER1Q9NX31 292 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 DGCR6Q14129 220 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 FBXO30Q8TB52 745 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SGSM3Q96HU1 749 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 GAKO14976 1311 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TMEM114B3SHH9 223 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PSMD9O00233 223 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 AXIN1O15169 862 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TLL1O43897 1013 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 XYLBO75191 536 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TIPRLO75663 272 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 IL6P05231 212 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 AKT2P31751 481 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 BOLA3Q53S33 107 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CNPY3Q9BT09 278 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ARMCX1Q9P291 453 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 COX7A2P14406 83 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CD86P42081 329 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 GALNT3Q14435 633 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PFKFB4Q16877 469 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 METTL6Q8TCB7 284 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PROX1Q92786 737 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SMARCD1Q96GM5 515 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 GMCL1Q96IK5 515 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SERPINB12Q96P63 405 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 GINS4Q9BRT9 223 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ACAT2Q9BWD1 397 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 FBXO44Q9H4M3 255 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 KLQ9UEF7 1012 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CLDN5O00501 218 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TMEM253P0C7T8 217 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TSNQ15631 228 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CCDC126Q96EE4 140 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 RIT2Q99578 217 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 EQTNQ9NQ60 294 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CDC73Q6P1J9 531 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CHPFQ8IZ52 775 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 DDHD1Q8NEL9 900 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 GAD1Q99259 594 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SLITRK2Q9H156 845 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.75□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CCDC189A1A4V9 331 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CCL16O15467 120 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SPAG6O75602 509 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CYP11B2P19099 503 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CEBPGP53567 150 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 HERVK_113P62684 666 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 GRB10Q13322 594 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SLC15A2Q16348 729 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 KLHL12Q53G59 568 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 AGBL2Q5U5Z8 902 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 USP45Q70EL2 814 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CFAP52Q8N1V2 620 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 RAD51AP1Q96B01 352 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SATB2Q9UPW6 733 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PIAS1O75925 651 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 PRG2P13727 222 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 VHLP40337 213 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 HK2P52789 917 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 IKBKEQ14164 716 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 SNX30Q5VWJ9 437 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ANKS1AQ92625 1134 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ATG10Q9H0Y0 220 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 MCUBQ9NWR8 336 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 ISM1B1AKI9 464 aa10.74□□□□□ -0.69
CLN8-201ENST00000331222 MYL12BO14950 172 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms