RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 CASP10Q92851 521 aa22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 E2F7Q96AV8 911 aa22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.24■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ITGA2BP08514 1039 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ARFIP2P53365 341 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TMPRSS15P98073 1019 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM135Q86UB9 458 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ATP2A3Q93084 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TSGA13Q96PP4 275 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 CPNE1Q99829 537 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 PSAT1Q9Y617 370 aa22.23■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 PATJQ8NI35 1801 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEB16A2A368 324 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 DFFAO00273 331 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 BIRC5O15392 142 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 USP1O94782 785 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 CCNCP24863 283 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 HOXC13P31276 330 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 GP5P40197 560 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 NPY2RP49146 381 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 PGFP49763 221 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 PPP2R5DQ14738 602 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 LZTR1Q8N653 840 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 C7orf26Q96N11 449 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 AP3B1O00203 1094 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TPP1O14773 563 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 PSMD3O43242 534 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 AOC2O75106 756 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 BPGMP07738 259 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 PDE1BQ01064 536 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 CHI3L2Q15782 390 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 GRTP1Q5TC63 336 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.22■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1W2PQH9 124 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 MNAT1P51948 309 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 BST1Q10588 318 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 MANEALQ5VSG8 457 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 KCNK13Q9HB14 408 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 NMUR1Q9HB89 426 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 GLRA3O75311 464 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 RIPK1Q13546 671 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 RAET1EQ8TD07 263 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINB11Q96P15 392 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 IL22Q9GZX6 179 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM51Q9NW97 253 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.21■■□□□ 1.15
SPHK1-201ENST00000323374 ATP9BO43861 1147 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 TADA2AO75478 443 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 ATP6V1G2O95670 118 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 KRT16P08779 473 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 DBN1Q16643 649 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 LINC00523Q86TU6 105 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 MON1AQ86VX9 555 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 LRMDAQ9H2I8 198 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 HEY2Q9UBP5 337 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 HAO1Q9UJM8 370 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 SCML2Q9UQR0 700 aa22.2■■□□□ 1.14
SPHK1-201ENST00000323374 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms