RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CITO14578 2027 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GUA9 196 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP73A6NFT4 308 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HEPACAM2A8MVW5 462 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 I3L4J1 428 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ACKR2O00590 384 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 B4GALT5O43286 388 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MAN1A2O60476 641 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SUN1O94901 812 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NPTXRO95502 500 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LRG1P02750 347 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PRB1P04280 392 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RALAP11233 206 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN2P17706 415 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ATICP31939 592 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PHBP35232 272 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IL9RQ01113 521 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TUSC3Q13454 348 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPSQ13938 189 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCINQ13939 588 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MORF4L2Q15014 288 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF699Q32M78 642 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PLK5Q496M5 336 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NOTUMQ6P988 496 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 UBR7Q8N806 425 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HHIPQ96QV1 700 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LHX5Q9H2C1 402 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNCQ9H7C4 482 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SNTG2Q9NY99 539 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP10Q9P2G4 905 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 INVSQ9Y283 1065 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ANK1P16157 1881 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 O00370 1275 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRG1O14668 218 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MOSPD3O75425 235 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSL3O95573 720 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SHBGP04278 402 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGAVP06756 1048 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MYL4P12829 197 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TSHRP16473 764 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXA6P31267 233 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 STX2P32856 288 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GJC1P36383 396 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEA4P43358 317 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARPP19P56211 112 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 POU5F1BQ06416 359 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 STILQ15468 1287 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TEAD2Q15562 447 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms