RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 NR5A2O00482 541 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FAM163BP0C2L3 166 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SLC7A2P52569 658 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 IMPG1Q17R60 797 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 BBS5Q8N3I7 341 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 NACA2Q9H009 215 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 CDH19Q9H159 772 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.61■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 MRASO14807 208 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 BIRC5O15392 142 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PCNAP12004 261 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TGM2P21980 687 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ADORA2AP29274 412 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 GRIA4P48058 902 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SULT2A1Q06520 285 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 INPP5AQ14642 412 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TKFCQ3LXA3 575 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ZACNQ401N2 412 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 USP33Q8TEY7 942 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 MRGBPQ9NV56 204 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TK2O00142 265 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 CD300CQ08708 224 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 STX5Q13190 355 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 MGAT5BQ3V5L5 792 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 RIN3Q8TB24 985 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 RNF34Q969K3 372 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SLC29A1Q99808 456 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PSAT1Q9Y617 370 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TMEM233B4DJY2 109 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ANGPT2O15123 496 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 HDAC3O15379 428 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 GPD1P21695 349 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PTP4A2Q12974 167 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SEPT3Q9UH03 358 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.6■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SERPINB2P05120 415 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 DHRS4L1P0CG22 281 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 RPL14P50914 215 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 INAQ16352 499 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 CYP51A1Q16850 503 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SNX15Q9NRS6 342 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 RXRBP28702 533 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 LILRA2Q8N149 483 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PPP1R14BQ96C90 147 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TRIM39Q9HCM9 518 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 A6NL46 340 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FASP25445 335 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TGFBIQ15582 683 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 MAPK15Q8TD08 544 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 TFAP2BQ92481 460 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 DLG3Q92796 817 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 FBXL20Q96IG2 436 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 GIN1Q9NXP7 522 aa16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 KLF11O14901 512 aa16.58■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 CHADO15335 359 aa16.58■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 METTL18O95568 372 aa16.58■□□□□ 0.25
GPC1-201ENST00000264039 LRPAP1P30533 357 aa16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms