RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 MCF2LO15068 1137 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 CYP17A1P05093 508 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 HTR4Q13639 388 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 AFMIDQ63HM1 303 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 CHST9Q7L1S5 443 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 MFSD6LQ8IWD5 586 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 TTC8Q8TAM2 541 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 HMCESQ96FZ2 354 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 BBS2Q9BXC9 721 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 AMACRQ9UHK6 382 aa26.77■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 RBP3P10745 1247 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 ACVRL1P37023 503 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 NR2C2P49116 596 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 MAPKAPK2P49137 400 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 NRLP54845 237 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 OASLQ15646 514 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 LEXMQ3ZCV2 418 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 PRUNE1Q86TP1 453 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 FAM83CQ9BQN1 747 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM121Q9BTD3 319 aa26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 V9GYY5 206 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
TOMM40-201ENST00000252487 COL4A3Q01955 1670 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 A0A0D9SEW6 157 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 H0Y626 953 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CYBBP04839 570 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 FCHO2Q0JRZ9 810 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GALNT2Q10471 571 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 DHCR24Q15392 516 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MFN1Q8IWA4 741 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 OR7D4Q8NG98 312 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 OTUB2Q96DC9 234 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC114Q96M63 670 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 HPS4Q9NQG7 708 aa26.76■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CHD5Q8TDI0 1954 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RASA4BC9J798 803 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RASA4O43374 803 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RAMP2O60895 175 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ECI2O75521 394 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RHOCP08134 193 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PSMC3P17980 439 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CDH18Q13634 790 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 YAF2Q8IY57 180 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC105Q8IYK2 499 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 NAT16Q8N8M0 369 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CCNYQ8ND76 341 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 E2F7Q96AV8 911 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF148Q9UQR1 794 aa26.75■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PENKP01210 267 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TYRP14679 529 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 VAV1P15498 845 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GDI1P31150 447 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 CHRNA3P32297 505 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GDF10P55107 478 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TEX35Q5T0J7 233 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MTSS1LQ765P7 747 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 LZTR1Q8N653 840 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 HINFPQ9BQA5 517 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 HOMER3Q9NSC5 361 aa26.74■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ANHXE9PGG2 379 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RAD51CO43502 376 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 IL9P15248 144 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RBL1P28749 1068 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GARSP41250 739 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GNA12Q03113 381 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 AP1B1Q10567 949 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 PDK1Q15118 436 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF354CQ86Y25 554 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM24O15164 1050 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 FNTAP49354 379 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 NDST2P52849 883 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 C6orf118Q5T5N4 469 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 MMGT1Q8N4V1 131 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 ATPAF2Q8N5M1 289 aa26.73■■□□□ 1.87
TOMM40-201ENST00000252487 GLIS1Q8NBF1 620 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms