RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PYROXD1Q8WU10 500 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM55Q9BYV6 548 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 E7ESA3 106 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXA9P31269 272 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 PCK1P35558 622 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ABL2P42684 1182 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 KAZNQ674X7 775 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF449Q6P9G9 518 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEHQ6S545 545 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A11Q8NBS3 891 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5C1AQ9BXI3 368 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF9Q9HAQ2 790 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT10P13645 584 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF132P52740 706 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC93AQ86WB7 457 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CHSY1Q86X52 802 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 GLIS1Q8NBF1 620 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNV2Q8TDN2 545 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CORO1BQ9BR76 489 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD10Q9BSF8 475 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK8Q8NF50 2099 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 SGK1O00141 431 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR2P41597 374 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN2BP42772 138 aa27.03■■□□□ 1.92
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRT72Q14CN4 511 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A9Q2M3M2 681 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 C2CD6Q53TS8 623 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM91A1Q658Y4 838 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC24Q6P3W2 148 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf50Q6ZRC1 276 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 PASD1Q8IV76 773 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN4BQ8IWT1 228 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC9Q8WXX5 260 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPM1 405 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 GPX6P59796 221 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 BANPQ8N9N5 519 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A14Q8TDB8 520 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEAL4Q96EI5 215 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 TNIP3Q96KP6 325 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 RIPOR3Q96MK2 946 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK16Q96T55 309 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 MANSC1Q9H8J5 431 aa27.02■■□□□ 1.92
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CAPNS1-201ENST00000246533 NPHS2Q9NP85 383 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 MAFFQ9ULX9 164 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 PI4K2BG5E9Z4 385 aa27.02■■□□□ 1.92
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CAPNS1-201ENST00000246533 HAUS5O94927 633 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CBX6O95503 412 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 GM2AP17900 193 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 VHLP40337 213 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH1A3P47895 512 aa27.02■■□□□ 1.92
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CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCB1Q12824 385 aa27.02■■□□□ 1.92
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM35BQ8NCS4 154 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ITFG1Q8TB96 612 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF606Q8WXB4 792 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 CD320Q9NPF0 282 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOP08100 348 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 GJA1P17302 382 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 KLC1Q07866 573 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 TJAP1Q5JTD0 557 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 DCUN1D2Q6PH85 259 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP24Q8N264 748 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF276Q8N554 614 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 NSL1Q96IY1 281 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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CAPNS1-201ENST00000246533 CLUHO75153 1309 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRD1A4D1F6 860 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 XYLBO75191 536 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 ADORA2BP29275 332 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 MTHFRP42898 656 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 CBLBQ13191 982 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO7Q6IWH7 933 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 MZB1Q8WU39 189 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM176AQ96HP8 235 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 PAFAH2Q99487 392 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC3Q9BY71 257 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 HSFX1Q9UBD0 423 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO10Q9HD67 2058 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-201ENST00000246533 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa27■■□□□ 1.91
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