RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52B2Q96RD2 323 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TCF7L2Q9NQB0 619 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 E2F8A0AVK6 867 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TMC7Q7Z402 723 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS28Q9UK41 221 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A096LPK6 155 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 DTNBP1Q96EV8 351 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIP11Q15643 1979 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3R1P27986 724 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ADORA2BP29275 332 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TTLL4Q14679 1199 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf89Q6UX73 402 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 STON2Q8WXE9 905 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINI1Q99574 410 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 IRF6O14896 467 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC22A2O15244 555 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 HCRTO43612 131 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 LGALS2P05162 132 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SMIM18P0DKX4 95 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SULT1E1P49888 294 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 HK2P52789 917 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 BNIPLQ7Z465 357 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 DEFB106AQ8N104 65 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 NETO2Q8NC67 525 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNYQ8ND76 341 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP7Q8WX94 980 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SCN4AP35499 1836 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 MATN2O00339 956 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCN2P51788 898 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 URGCPQ8TCY9 931 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 NDNQ99608 321 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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HTATSF1-201ENST00000218364 OXSMQ9NWU1 459 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPN8A6NHC0 703 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 IRF9Q00978 393 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TLR1Q15399 786 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PID1Q7Z2X4 250 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 GCNAQ96QF7 691 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 MID2Q9UJV3 735 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 COL1A2P08123 1366 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SCN1AP35498 2009 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1B0GVG6 124 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 TXNDC9O14530 226 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP9BO43861 1147 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 AP2A1O95782 977 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 C2P06681 752 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP1Q07960 439 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 DPYSQ14117 519 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SATL1Q86VE3 508 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 KYQ8NBH2 561 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 NT5C3BQ969T7 300 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX27Q96L92 541 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 AGAP2Q99490 1192 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CASS4Q9NQ75 786 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CITO14578 2027 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CSRP3P50461 194 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 BFARQ9NZS9 450 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 DAB1O75553 588 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 LTFP02788 710 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINB5P36952 375 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDT2P50583 147 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 OLIG2Q13516 323 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD2Q14681 263 aa22.59■■□□□ 1.21
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