RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 TULP3O75386 442 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 ADH1CP00326 375 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 LMAN2Q12907 356 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 MPP7Q5T2T1 576 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 AFMIDQ63HM1 303 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM215Q68D42 235 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 CPA6Q8N4T0 437 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 OR7D4Q8NG98 312 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 FBXO10Q9UK96 956 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.53■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 CLDN11O75508 207 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 GLDCP23378 1020 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 OR1E1P30953 314 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 COPS2P61201 443 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 GAD2Q05329 585 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 BBS12Q6ZW61 710 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 VSIG1Q86XK7 387 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 CREG2Q8IUH2 290 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 MFN1Q8IWA4 741 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 APCDD1Q8J025 514 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 LRRC19Q9H756 370 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.52■□□□□ 0.88
KDELR3-201ENST00000216014 NCOR1O75376 2440 aa20.52■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 H0Y626 953 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CYBBP04839 570 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SRFP11831 508 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 HTR7P34969 479 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CSKP41240 450 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 KDSRQ06136 332 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 GEN1Q17RS7 908 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 ODF2Q5BJF6 829 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 FIBINQ8TAL6 211 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 DTLQ9NZJ0 730 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.51■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 APOL1O14791 398 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 FGGP02679 453 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 HMCESQ96FZ2 354 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CTHP32929 405 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CDH18Q13634 790 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 FUT11Q495W5 492 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 GJD3Q8N144 294 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 PBKQ96KB5 322 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 HCN2Q9UL51 889 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.5■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 RHOCP08134 193 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 PRLRP16471 622 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CD72P21854 359 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 MAPKAPK2P49137 400 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 TTC28Q96AY4 2481 aa20.49■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 RASA4BC9J798 803 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 PRRT4C9JH25 899 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 RASA4O43374 803 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 SNAP91O60641 907 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 GNA12Q03113 381 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 DNASE1L2Q92874 299 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 OLFM3Q96PB7 478 aa20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KDELR3-201ENST00000216014 GGA2Q9UJY4 613 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms