RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.89■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.88■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 FOXO3O43524 673 aa26.88■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.86■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 PSME1Q06323 249 aa26.85■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 FYB1O15117 783 aa26.84■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 BRINP3Q76B58 766 aa26.84■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.84■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 SSH2Q76I76 1423 aa26.84■■□□□ 1.89
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.82■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.82■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.82■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.81■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 RALBP1Q15311 655 aa26.81■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 NME9Q86XW9 330 aa26.81■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 NSD2O96028 1365 aa26.79■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.79■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 CERKQ8TCT0 537 aa26.78■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.78■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 MORC1Q86VD1 984 aa26.77■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.77■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
CLN8-208ENST00000635751 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.76■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.76■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.76■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 PIK3C2AO00443 1686 aa26.75■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.75■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 TOM1O60784 492 aa26.74■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.72■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 ABTB2Q8N961 1025 aa26.72■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.71■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 COG3Q96JB2 828 aa26.71■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 PXDNQ92626 1479 aa26.7■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.7■■□□□ 1.87
CLN8-208ENST00000635751 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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CLN8-208ENST00000635751 NLRP6P59044 892 aa26.68■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 PIP4K2BP78356 416 aa26.68■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 ALS2Q96Q42 1657 aa26.68■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.67■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.67■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.67■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 USP31Q70CQ4 1352 aa26.66■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 USP54Q70EL1 1684 aa26.65■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 SBNO1A3KN83 1393 aa26.65■■□□□ 1.86
CLN8-208ENST00000635751 FBLN1P23142 703 aa26.64■■□□□ 1.85
CLN8-208ENST00000635751 NLRP13Q86W25 1043 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN8-208ENST00000635751 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.62■■□□□ 1.85
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CLN8-208ENST00000635751 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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CLN8-208ENST00000635751 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.58■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 MTHFSP49914 203 aa26.57■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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CLN8-208ENST00000635751 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.55■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF10O15013 1369 aa26.54■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 POLKQ9UBT6 870 aa26.54■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.52■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 USP19O94966 1318 aa26.51■■□□□ 1.84
CLN8-208ENST00000635751 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 SLIT3O75094 1523 aa26.51■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.51■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 LTN1O94822 1766 aa26.51■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 GCP02774 474 aa26.5■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.5■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.49■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 NFAT5O94916 1531 aa26.48■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 PEAK1Q9H792 1746 aa26.46■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.46■■□□□ 1.83
CLN8-208ENST00000635751 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
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CLN8-208ENST00000635751 ABCA3Q99758 1704 aa26.44■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.42■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.42■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 AMPHP49418 695 aa26.42■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 NUDCQ9Y266 331 aa26.42■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 SHPRHQ149N8 1683 aa26.41■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CLN8-208ENST00000635751 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
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