RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609354.1

RGPD4-AS1-205, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 860 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.77□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.77□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.76□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.75□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MPNDQ8N594 471 aa9.75□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.74□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 KCNH2Q12809 1159 aa9.74□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 DESI1Q6ICB0 168 aa9.74□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 FAM117AQ9C073 453 aa9.74□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.73□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 H3BM21 787 aa9.73□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NDUFV2P19404 249 aa9.73□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 GMPRP36959 345 aa9.73□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.73□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 LINC01559Q495D7 138 aa9.72□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ZNF511Q8NB15 262 aa9.72□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.72□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PRR7Q8TB68 274 aa9.72□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 BAP1Q92560 729 aa9.72□□□□□ -0.85
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MTMR2Q13614 643 aa9.71□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ZFP42Q96MM3 310 aa9.71□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.71□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NNTQ13423 1086 aa9.7□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.7□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 SCARF1Q14162 830 aa9.69□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.69□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 GJA5P36382 358 aa9.68□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.68□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 SPTLC1O15269 473 aa9.67□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ADH1CP00326 375 aa9.67□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 VEGFBP49765 207 aa9.67□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 IL27Q8NEV9 243 aa9.67□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.67□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ERBB4Q15303 1308 aa9.65□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 TIMP2P16035 220 aa9.65□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.65□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.65□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.65□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.64□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.64□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 LYPD8Q6UX82 237 aa9.64□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 CTHP32929 405 aa9.63□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 CDK15Q96Q40 435 aa9.62□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 VSIG8P0DPA2 414 aa9.61□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.61□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.61□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 HRCP23327 699 aa9.6□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.6□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NR5A1Q13285 461 aa9.59□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 QPCTQ16769 361 aa9.59□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 CFAP99D6REC4 459 aa9.57□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 LILRB3O75022 631 aa9.57□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ARID5BQ14865 1188 aa9.57□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 FOXJ1Q92949 421 aa9.57□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 GOPCQ9HD26 462 aa9.57□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MAN1A2O60476 641 aa9.56□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MAP10Q9P2G4 905 aa9.56□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 SOBPA7XYQ1 873 aa9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 UPP2O95045 317 aa9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 AGERQ15109 404 aa9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ITPKCQ96DU7 683 aa9.54□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NR3C2P08235 984 aa9.52□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 GRM5P41594 1212 aa9.52□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.52□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.52□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 TSC1Q92574 1164 aa9.52□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 BMP2P12643 396 aa9.51□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.51□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.51□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MEIOBQ8N635 442 aa9.51□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PPFIA3O75145 1194 aa9.49□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 NBPF14Q5TI25 921 aa9.49□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.49□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.49□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-205ENST00000609354 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms