RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 SSH2Q76I76 1423 aa27.66■■■□□ 2.02
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FCHO1-232ENST00000600209 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-232ENST00000600209 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-232ENST00000600209 ALS2Q96Q42 1657 aa27.62■■■□□ 2.01
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FCHO1-232ENST00000600209 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.6■■■□□ 2.01
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FCHO1-232ENST00000600209 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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FCHO1-232ENST00000600209 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.47■■□□□ 1.99
FCHO1-232ENST00000600209 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
FCHO1-232ENST00000600209 USP54Q70EL1 1684 aa27.46■■□□□ 1.99
FCHO1-232ENST00000600209 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
FCHO1-232ENST00000600209 USP19O94966 1318 aa27.44■■□□□ 1.98
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FCHO1-232ENST00000600209 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.43■■□□□ 1.98
FCHO1-232ENST00000600209 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.43■■□□□ 1.98
FCHO1-232ENST00000600209 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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FCHO1-232ENST00000600209 ABCA3Q99758 1704 aa27.41■■□□□ 1.98
FCHO1-232ENST00000600209 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
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FCHO1-232ENST00000600209 GCP02774 474 aa27.4■■□□□ 1.98
FCHO1-232ENST00000600209 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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FCHO1-232ENST00000600209 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
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FCHO1-232ENST00000600209 NFAT5O94916 1531 aa27.29■■□□□ 1.96
FCHO1-232ENST00000600209 SOX12O15370 315 aa27.28■■□□□ 1.96
FCHO1-232ENST00000600209 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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FCHO1-232ENST00000600209 KIAA0232Q92628 1395 aa27.26■■□□□ 1.95
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FCHO1-232ENST00000600209 FAM83GA6ND36 823 aa27.26■■□□□ 1.95
FCHO1-232ENST00000600209 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.26■■□□□ 1.95
FCHO1-232ENST00000600209 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.24■■□□□ 1.95
FCHO1-232ENST00000600209 NGLY1Q96IV0 654 aa27.24■■□□□ 1.95
FCHO1-232ENST00000600209 LTN1O94822 1766 aa27.24■■□□□ 1.95
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FCHO1-232ENST00000600209 COL18A1P39060 1754 aa27.2■■□□□ 1.95
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FCHO1-232ENST00000600209 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.19■■□□□ 1.94
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FCHO1-232ENST00000600209 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 SLIT2O94813 1529 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 AMPHP49418 695 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 IP6K1Q92551 441 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 RGPD5Q99666 1765 aa27.15■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 BTG4Q9NY30 223 aa27.15■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 AFF2P51816 1311 aa27.15■■□□□ 1.94
FCHO1-232ENST00000600209 RALBP1Q15311 655 aa27.14■■□□□ 1.94
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