RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	ACE	P12821	1306 aa		31.63	■■■□□ 2.65
APBA3-208	ENST00000592826	TESK2	Q96S53	571 aa		31.6	■■■□□ 2.65
APBA3-208	ENST00000592826	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.6	■■■□□ 2.65
APBA3-208	ENST00000592826	USP21	Q9UK80	565 aa		31.6	■■■□□ 2.65
APBA3-208	ENST00000592826	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
APBA3-208	ENST00000592826	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
APBA3-208	ENST00000592826	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
APBA3-208	ENST00000592826	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.56	■■■□□ 2.64
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
APBA3-208	ENST00000592826	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
APBA3-208	ENST00000592826	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
APBA3-208	ENST00000592826	TMF1	P82094	1093 aa		31.53	■■■□□ 2.64
APBA3-208	ENST00000592826	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.51	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	ATRN	O75882	1429 aa		31.49	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.49	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.47	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.47	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	USP6	P35125	1406 aa		31.46	■■■□□ 2.63
APBA3-208	ENST00000592826	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31.43	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.43	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		31.41	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.41	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.41	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	SSH2	Q76I76	1423 aa		31.4	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.39	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
APBA3-208	ENST00000592826	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.38	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		31.37	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.36	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.35	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.33	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.33	■■■□□ 2.61
APBA3-208	ENST00000592826	EP400	Q96L91	3159 aa		31.32	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC125	Q86Z20	511 aa		31.32	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		31.32	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.31	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	USP19	O94966	1318 aa		31.3	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	NLRP6	P59044	892 aa		31.3	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		31.3	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	SLIT2	O94813	1529 aa		31.29	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.28	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.28	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826		A0A1W2PP64	1363 aa		31.27	■■■□□ 2.6
APBA3-208	ENST00000592826	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.26	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.26	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	GC	P02774	474 aa		31.25	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		31.24	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		31.24	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.23	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.23	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.22	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.22	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	GLI3	P10071	1580 aa		31.22	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	CPD	O75976	1380 aa		31.21	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.21	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.21	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.2	■■■□□ 2.59
APBA3-208	ENST00000592826	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.19	■■■□□ 2.58
APBA3-208	ENST00000592826	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
APBA3-208	ENST00000592826	SLIT3	O75094	1523 aa		31.18	■■■□□ 2.58
APBA3-208	ENST00000592826	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.16	■■■□□ 2.58
APBA3-208	ENST00000592826	VPS72	Q15906	364 aa		31.15	■■■□□ 2.58
APBA3-208	ENST00000592826	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		31.15	■■■□□ 2.58
APBA3-208	ENST00000592826	NME9	Q86XW9	330 aa		31.13	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		31.12	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.11	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.1	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		31.1	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.1	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	MYOM1	P52179	1685 aa		31.08	■■■□□ 2.57
APBA3-208	ENST00000592826	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.07	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	COG3	Q96JB2	828 aa		31.07	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.06	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	EVA1C	P58658	441 aa		31.05	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.05	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.05	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	NRAP	Q86VF7	1730 aa		31.04	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	FYB1	O15117	783 aa		31.03	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.03	■■■□□ 2.56
APBA3-208	ENST00000592826	NFAT5	O94916	1531 aa		31.01	■■■□□ 2.55
APBA3-208	ENST00000592826	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		31	■■■□□ 2.55
APBA3-208	ENST00000592826	SOX12	O15370	315 aa		31	■■■□□ 2.55
APBA3-208	ENST00000592826	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31	■■■□□ 2.55
APBA3-208	ENST00000592826	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		31	■■■□□ 2.55
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		30.99	■■■□□ 2.55

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