RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.1■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 SMC5Q8IY18 1101 aa25.1■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 ABCC11Q96J66 1382 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 FSD2A1L4K1 749 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 A0A1W2PP64 1363 aa25.09■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ILF3-217ENST00000589998 ABCC3O15438 1527 aa25.08■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.08■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.07■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.07■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.06■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 PIK3C2BO00750 1634 aa25.06■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 IL16Q14005 1332 aa25.05■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 HSCBQ8IWL3 235 aa25.04■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.04■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 TRAK2O60296 914 aa25.04■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.02■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.01■■□□□ 1.6
ILF3-217ENST00000589998 PANK2Q9BZ23 570 aa25.01■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 KIF16BQ96L93 1317 aa25.01■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 RIPK4P57078 832 aa25■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 MLH3Q9UHC1 1453 aa25■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 NUCB1Q02818 461 aa24.99■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 LNPKQ9C0E8 428 aa24.98■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.97■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 FYB1O15117 783 aa24.97■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 DDIT3P35638 169 aa24.97■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.96■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 MED14O60244 1454 aa24.96■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 STK26Q9P289 416 aa24.96■■□□□ 1.59
ILF3-217ENST00000589998 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.94■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 SNX21Q969T3 373 aa24.94■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.94■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.94■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.94■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.93■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.92■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 MRE11P49959 708 aa24.92■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.92■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.92■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 PTPRMP28827 1452 aa24.91■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.9■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.89■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ILF3-217ENST00000589998 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.89■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 ZFYVE9O95405 1425 aa24.88■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.88■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.88■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 IDI1Q13907 227 aa24.87■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.86■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 CLCN1P35523 988 aa24.86■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 KIF2CQ99661 725 aa24.86■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.85■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 PRAM1Q96QH2 718 aa24.85■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 FCHSD2O94868 740 aa24.84■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.84■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 PRKAR2BP31323 418 aa24.83■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.83■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.83■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 ZNF428Q96B54 188 aa24.83■■□□□ 1.57
ILF3-217ENST00000589998 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 GCC1Q96CN9 775 aa24.82■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.82■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 GBP4Q96PP9 640 aa24.82■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 PTCH1Q13635 1447 aa24.81■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 PIK3R4Q99570 1358 aa24.81■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.8■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.8■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.8■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 VAMP4O75379 141 aa24.79■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.78■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.78■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ILF3-217ENST00000589998 FBLN1P23142 703 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms