RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 NME9Q86XW9 330 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 COG3Q96JB2 828 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 OVOS2Q6IE36 1432 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-207ENST00000589146 USP31Q70CQ4 1352 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.32■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 DCCP43146 1447 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.31■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 C14orf37Q86TY3 774 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 POLKQ9UBT6 870 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 USP54Q70EL1 1684 aa30.29■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM94Q12767 1356 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE3BQ13370 1112 aa30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CAPNS1-207ENST00000589146 NGEFQ8N5V2 710 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 NUDCQ9Y266 331 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3C2AO00443 1686 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF1AQ12756 1690 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-207ENST00000589146 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 RUNDC1Q96C34 613 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MST1RQ04912 1400 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF521Q96K83 1311 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ATF3P18847 181 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 FBLN1P23142 703 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 APAF1O14727 1248 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 ORAI2Q96SN7 254 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-207ENST00000589146 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MSH6P52701 1360 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PSME1Q06323 249 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 IL13P35225 146 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP6P59044 892 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHF1Q96S99 279 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PEAK1Q9H792 1746 aa30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 ABTB2Q8N961 1025 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 FCHSD2O94868 740 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC27Q2M243 656 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 SBNO1A3KN83 1393 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXO3O43524 673 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA2Q08379 1002 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 FLT4P35916 1363 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SLIT3O75094 1523 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NFAT5O94916 1531 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 SLFN5Q08AF3 891 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 WWC1Q8IX03 1113 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 ALS2Q96Q42 1657 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NEFLP07196 543 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 RTL1A6NKG5 1358 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR63Q8IWG1 891 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 USP19O94966 1318 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-207ENST00000589146 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
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