RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.37■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.36■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.36■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 PSME1Q06323 249 aa15.35■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.35■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.35■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.34■□□□□ 0.05
EFTUD2-209ENST00000587957 RXRBP28702 533 aa15.33■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 ITSN1Q15811 1721 aa15.33■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.33■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.33■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 USP21Q9UK80 565 aa15.32■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.31■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.31■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP7BP35670 1465 aa15.3■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.3■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.3■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 CDK19Q9BWU1 502 aa15.29■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 SBNO1A3KN83 1393 aa15.28■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF10O15013 1369 aa15.28■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA3Q99758 1704 aa15.28■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 TONSLQ96HA7 1378 aa15.27■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
EFTUD2-209ENST00000587957 RGS12O14924 1447 aa15.26■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.25■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 CHADLQ6NUI6 762 aa15.24■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.24■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 ALS2Q96Q42 1657 aa15.24■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 CABP2Q9NPB3 220 aa15.23■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 ATRNO75882 1429 aa15.23■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.22■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.21■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.21■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.21■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.21■□□□□ 0.03
EFTUD2-209ENST00000587957 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 ACEP12821 1306 aa15.2■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 SLIT2O94813 1529 aa15.19■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.19■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR29P0C7W0 189 aa15.19■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.19■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 EVC2Q86UK5 1308 aa15.18■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.18■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A0G2JS52 829 aa15.17■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 MYT1Q01538 1121 aa15.17■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.17■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.17■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.16■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.16■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.16■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 GLI3P10071 1580 aa15.15■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM83GA6ND36 823 aa15.15■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 ABTB2Q8N961 1025 aa15.15■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
EFTUD2-209ENST00000587957 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.14■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 BTG4Q9NY30 223 aa15.14■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 CABP1Q9NZU7 370 aa15.14■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 NRAPQ86VF7 1730 aa15.14■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.13■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.13■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0232Q92628 1395 aa15.12■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 CHRNA2Q15822 529 aa15.12■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.11■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 VPS72Q15906 364 aa15.11■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 USP6P35125 1406 aa15.1■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 STRN4Q9NRL3 753 aa15.1■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 BRWD3Q6RI45 1802 aa15.09■□□□□ 0.01
EFTUD2-209ENST00000587957 NLRP13Q86W25 1043 aa15.08■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.08■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 AKAP12Q02952 1782 aa15.08■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 SOX12O15370 315 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 NLRP6P59044 892 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 TMC1Q8TDI8 760 aa15.07■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 PIK3C2AO00443 1686 aa15.06■□□□□ 0
EFTUD2-209ENST00000587957 EVA1CP58658 441 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-209ENST00000587957 USP35Q9P2H5 1018 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms