RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIPK4P57078 832 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ALKQ9UM73 1620 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SEC24BO95487 1268 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TSPOAP1O95153 1857 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HMOX1P09601 288 aa15.83■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRIM27P14373 513 aa15.83■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AAMPQ13685 434 aa15.83■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP35Q9P2H5 1018 aa15.83■□□□□ 0.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRKAR2BP31323 418 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NLRP1Q9C000 1473 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADGRB2O60241 1585 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLKQ9UBT6 870 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NFKBIBQ15653 356 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.81■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FCHSD2O94868 740 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NME9Q86XW9 330 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP19O94966 1318 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MED14O60244 1454 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL16Q14005 1332 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.77■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.77■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DIP2BQ9P265 1576 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 METP08581 1390 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIF16BQ96L93 1317 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUTM2FA1L443 756 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NFE2L2Q16236 605 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COG3Q96JB2 828 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BECN1Q14457 450 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP7BP35670 1465 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZMYM3Q14202 1370 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AGLP35573 1532 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL13P35225 146 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.71■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TSPYL6Q8N831 410 aa15.71■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.71■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DLC1Q96QB1 1528 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TBC1D32Q96NH3 1257 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM83GA6ND36 823 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DCTN1Q14203 1278 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBIPQ9NS73 344 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SOX12O15370 315 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VAMP4O75379 141 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GNAI1P63096 354 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms