RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 KCNMA1Q12791 1236 aa8.97□□□□□ -0.97
TMOD3-202ENST00000558300 SCARF1Q14162 830 aa8.97□□□□□ -0.97
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TMOD3-202ENST00000558300 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-202ENST00000558300 LINC01559Q495D7 138 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-202ENST00000558300 PRR7Q8TB68 274 aa8.95□□□□□ -0.98
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TMOD3-202ENST00000558300 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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TMOD3-202ENST00000558300 MAN1A2O60476 641 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-202ENST00000558300 SLC24A1O60721 1099 aa8.86□□□□□ -0.99
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TMOD3-202ENST00000558300 MEIOBQ8N635 442 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-202ENST00000558300 CFAP99D6REC4 459 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-202ENST00000558300 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
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TMOD3-202ENST00000558300 KRT76Q01546 638 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-202ENST00000558300 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-202ENST00000558300 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.83□□□□□ -1
TMOD3-202ENST00000558300 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.83□□□□□ -1
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TMOD3-202ENST00000558300 MAP10Q9P2G4 905 aa8.82□□□□□ -1
TMOD3-202ENST00000558300 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.82□□□□□ -1
TMOD3-202ENST00000558300 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.81□□□□□ -1
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TMOD3-202ENST00000558300 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.78□□□□□ -1
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TMOD3-202ENST00000558300 PTSQ03393 145 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-202ENST00000558300 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.74□□□□□ -1.01
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TMOD3-202ENST00000558300 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.74□□□□□ -1.01
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TMOD3-202ENST00000558300 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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TMOD3-202ENST00000558300 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.73□□□□□ -1.01
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TMOD3-202ENST00000558300 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.7□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 SLC35F4A4IF30 521 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-202ENST00000558300 IGHA1P01876 353 aa8.69□□□□□ -1.02
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