RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554259.5

RALGAPA1-206, Transcript of Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1, human

TSL 5

Gene RALGAPA1, Length 3,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PTPRK	Q15262	1439 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RALGAPA1-206	ENST00000554259	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RALGAPA1-206	ENST00000554259	KDM5C	P41229	1560 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RALGAPA1-206	ENST00000554259	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	MIA2	Q96PC5	1412 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	C14orf37	Q86TY3	774 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NBPF3	Q9H094	633 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	STRC	Q7RTU9	1775 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PRSS12	P56730	875 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	ABCC1	P33527	1531 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PLA2R1	Q13018	1463 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	ATP7A	Q04656	1500 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	RERE	Q9P2R6	1566 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	ABCA6	Q8N139	1617 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	IGHA1	P01876	353 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NBR1	Q14596	966 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	C3	P01024	1663 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	TSKS	Q9UJT2	592 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	LTK	P29376	864 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	TREML4	Q6UXN2	200 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PREX2	Q70Z35	1606 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	KANK1	Q14678	1352 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	DGAT1	O75907	488 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PACS2	Q86VP3	889 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	EYA1	Q99502	592 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CPS1	P31327	1500 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	KCNA6	P17658	529 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	IDI1	Q13907	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SLAIN2	Q9P270	581 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NLRP1	Q9C000	1473 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	MBD5	Q9P267	1494 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CEP162	Q5TB80	1403 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SLC24A1	O60721	1099 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NECTIN2	Q92692	538 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PZP	P20742	1482 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NBPF26	B4DH59	902 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	ATF3	P18847	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PTGDR	Q13258	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	WNT2B	Q93097	391 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	GPR37	O15354	613 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	PROX2	Q3B8N5	592 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	POTEA	Q6S8J7	498 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	DDX12P	Q92771	950 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	STAC3	Q96MF2	364 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NCOA2	Q15596	1464 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	TMEM94	Q12767	1356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	TRIM52	Q96A61	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RALGAPA1-206	ENST00000554259	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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