RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553894.6

RPS6KL1-205, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, human

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 1,626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KL1-205	ENST00000553894	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	AKAP12	Q02952	1782 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NSD2	O96028	1365 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ANP32C	O43423	234 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ABTB2	Q8N961	1025 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NME9	Q86XW9	330 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		28.95	■■■□□ 2.23
RPS6KL1-205	ENST00000553894	RALBP1	Q15311	655 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PXDN	Q92626	1479 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	COG3	Q96JB2	828 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NLRP6	P59044	892 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MORC1	Q86VD1	984 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	USP31	Q70CQ4	1352 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NLRP13	Q86W25	1043 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MIER1	Q8N108	512 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PIK3C2A	O00443	1686 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	USP19	O94966	1318 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RPS6KL1-205	ENST00000553894	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	GC	P02774	474 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.72	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	HSPA1L	P34931	641 aa		28.72	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SOX12	O15370	315 aa		28.71	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.7	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.7	■■■□□ 2.19
RPS6KL1-205	ENST00000553894	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	FBLN1	P23142	703 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	POLK	Q9UBT6	870 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	USP54	Q70EL1	1684 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MTHFS	P49914	203 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	JCAD	Q9P266	1359 aa		28.67	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SLIT3	O75094	1523 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		28.63	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	AMPH	P49418	695 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NFAT5	O94916	1531 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CPD	O75976	1380 aa		28.59	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	IP6K1	Q92551	441 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	INSR	P06213	1382 aa		28.56	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	FLT4	P35916	1363 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	HOXC9	P31274	260 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	RTL1	A6NKG5	1358 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
RPS6KL1-205	ENST00000553894	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
RPS6KL1-205	ENST00000553894	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
RPS6KL1-205	ENST00000553894	SHPRH	Q149N8	1683 aa		28.5	■■■□□ 2.15
RPS6KL1-205	ENST00000553894	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
RPS6KL1-205	ENST00000553894	FAM83G	A6ND36	823 aa		28.5	■■■□□ 2.15

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