RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 ZMYM3Q14202 1370 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRB-211ENST00000552253 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRB-211ENST00000552253 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-211ENST00000552253 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.59□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 IL16Q14005 1332 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 CDK19Q9BWU1 502 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 CABP1Q9NZU7 370 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 SMC5Q8IY18 1101 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 POLKQ9UBT6 870 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 POGKQ9P215 609 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRB-211ENST00000552253 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRB-211ENST00000552253 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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PTPRB-211ENST00000552253 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 NUCB1Q02818 461 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRB-211ENST00000552253 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 TSPYL6Q8N831 410 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 NFE2L2Q16236 605 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-211ENST00000552253 METP08581 1390 aa7.5□□□□□ -1.21
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