RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF10O15013 1369 aa21.74■■□□□ 1.07
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CTDSP2-202ENST00000547169 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 SSH2Q76I76 1423 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 AKAP12Q02952 1782 aa21.72■■□□□ 1.07
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CTDSP2-202ENST00000547169 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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CTDSP2-202ENST00000547169 ALS2Q96Q42 1657 aa21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2-202ENST00000547169 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2-202ENST00000547169 MYOM1P52179 1685 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2-202ENST00000547169 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2-202ENST00000547169 A0A1W2PP64 1363 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDSP2-202ENST00000547169 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.67■■□□□ 1.06
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CTDSP2-202ENST00000547169 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.65■■□□□ 1.06
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CTDSP2-202ENST00000547169 NLRP6P59044 892 aa21.63■■□□□ 1.05
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CTDSP2-202ENST00000547169 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
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CTDSP2-202ENST00000547169 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.62■■□□□ 1.05
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CTDSP2-202ENST00000547169 PANK3Q9H999 370 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-202ENST00000547169 USP31Q70CQ4 1352 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2-202ENST00000547169 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2-202ENST00000547169 NME9Q86XW9 330 aa21.58■■□□□ 1.05
CTDSP2-202ENST00000547169 PIK3C2AO00443 1686 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-202ENST00000547169 GCP02774 474 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2-202ENST00000547169 NGLY1Q96IV0 654 aa21.57■■□□□ 1.04
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CTDSP2-202ENST00000547169 C8orf37Q96NL8 207 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDSP2-202ENST00000547169 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDSP2-202ENST00000547169 FYB1O15117 783 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDSP2-202ENST00000547169 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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CTDSP2-202ENST00000547169 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDSP2-202ENST00000547169 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTDSP2-202ENST00000547169 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-202ENST00000547169 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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CTDSP2-202ENST00000547169 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.49■■□□□ 1.03
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CTDSP2-202ENST00000547169 CPDO75976 1380 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-202ENST00000547169 KIAA0232Q92628 1395 aa21.49■■□□□ 1.03
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CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.47■■□□□ 1.03
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CTDSP2-202ENST00000547169 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-202ENST00000547169 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-202ENST00000547169 SOX12O15370 315 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDSP2-202ENST00000547169 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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CTDSP2-202ENST00000547169 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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CTDSP2-202ENST00000547169 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2-202ENST00000547169 ATRNO75882 1429 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2-202ENST00000547169 COL18A1P39060 1754 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2-202ENST00000547169 EVA1CP58658 441 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2-202ENST00000547169 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.37■■□□□ 1.01
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CTDSP2-202ENST00000547169 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2-202ENST00000547169 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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