RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546806.1

TPK1-208, Transcript of thiamin pyrophosphokinase 1, human

TSL 3

Gene TPK1, Length 460 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPK1-208	ENST00000546806	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	QPCT	Q16769	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPK1-208	ENST00000546806	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	LILRB3	O75022	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	CTH	P32929	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	MPND	Q8N594	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	IRF7	Q92985	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPK1-208	ENST00000546806	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	TSC1	Q92574	1164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	GRM5	P41594	1212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	NNT	Q13423	1086 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	BMP1	P13497	986 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	TIMP2	P16035	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	GMPR	P36959	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806		H3BM21	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	ADH1C	P00326	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	NR3C2	P08235	984 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	SCARF1	Q14162	830 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	AGER	Q15109	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	SLC24A1	O60721	1099 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	NR6A1	Q15406	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPK1-208	ENST00000546806	VEGFB	P49765	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	NR5A1	Q13285	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	SOBP	A7XYQ1	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	AP1G2	O75843	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPK1-208	ENST00000546806	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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