RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		12.62	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		12.62	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	JCAD	Q9P266	1359 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	PIK3C2A	O00443	1686 aa		12.61	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	ABCA3	Q99758	1704 aa		12.6	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		12.6	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	12.6	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	SSH2	Q76I76	1423 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	LRP6	O75581	1613 aa		12.59	□□□□□ -0.39
RBM25-208	ENST00000530978	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		12.58	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.58	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	NME9	Q86XW9	330 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		12.57	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.56	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.56	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	PANK3	Q9H999	370 aa		12.55	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	NLRP6	P59044	892 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	SOX12	O15370	315 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	USP54	Q70EL1	1684 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-208	ENST00000530978	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	SLIT3	O75094	1523 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	NLRP13	Q86W25	1043 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	USP19	O94966	1318 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	FYB1	O15117	783 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	C8orf37	Q96NL8	207 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	NFAT5	O94916	1531 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	KIAA0232	Q92628	1395 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	GC	P02774	474 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	FBLN1	P23142	703 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	CHRNA2	Q15822	529 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	COG3	Q96JB2	828 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	LTN1	O94822	1766 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RBM25-208	ENST00000530978	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	AFF2	P51816	1311 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	RGPD5	Q99666	1765 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	FAM83G	A6ND36	823 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	NGLY1	Q96IV0	654 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	COL18A1	P39060	1754 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	NRAP	Q86VF7	1730 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	PEAK1	Q9H792	1746 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	CPD	O75976	1380 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	NSD2	O96028	1365 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	SLIT2	O94813	1529 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	BTG4	Q9NY30	223 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	USP21	Q9UK80	565 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RBM25-208	ENST00000530978	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.4	□□□□□ -0.43

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