RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530484.1

USP17L3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L3, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3-201ENST00000530484 NUTM2FA1L443 756 aa15.6■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 NME9Q86XW9 330 aa15.6■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 NGEFQ8N5V2 710 aa15.6■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.6■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.6■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.6■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 NEFLP07196 543 aa15.59■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.58■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 COG3Q96JB2 828 aa15.58■□□□□ 0.09
USP17L3-201ENST00000530484 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.58■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.57■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.57■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.56■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 POLKQ9UBT6 870 aa15.56■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 ZNF521Q96K83 1311 aa15.56■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.55■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.55■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 RUNDC1Q96C34 613 aa15.54■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.54■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.54■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 APAF1O14727 1248 aa15.53■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 FKBP8Q14318 412 aa15.53■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 USP54Q70EL1 1684 aa15.53■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 USP31Q70CQ4 1352 aa15.52■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 PIK3C2AO00443 1686 aa15.52■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.52■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.52■□□□□ 0.08
USP17L3-201ENST00000530484 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 HSPA2P54652 639 aa15.52■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 STRCQ7RTU9 1775 aa15.51■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.51■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 C14orf37Q86TY3 774 aa15.51■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.51■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.5■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.5■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 GOLGA2Q08379 1002 aa15.49■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.49■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 FBLN1P23142 703 aa15.49■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.49■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 DCCP43146 1447 aa15.49■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.48■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.48■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 CCDC27Q2M243 656 aa15.47■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 KIF1AQ12756 1690 aa15.47■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.46■□□□□ 0.07
USP17L3-201ENST00000530484 TMEM94Q12767 1356 aa15.46■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 FCHSD2O94868 740 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 SLFN5Q08AF3 891 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 WWC1Q8IX03 1113 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 PEAK1Q9H792 1746 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 IL13P35225 146 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.45■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.44■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 E9PSI1 815 aa15.44■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.43■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 NLRP6P59044 892 aa15.43■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 WDR63Q8IWG1 891 aa15.42■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.42■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 SBNO1A3KN83 1393 aa15.42■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.42■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 MST1RQ04912 1400 aa15.41■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 PSME1Q06323 249 aa15.41■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 ABTB2Q8N961 1025 aa15.41■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 ATF3P18847 181 aa15.41■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 ORAI2Q96SN7 254 aa15.41■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 FLT4P35916 1363 aa15.4■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.4■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.4■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 NEUROD2Q15784 382 aa15.4■□□□□ 0.06
USP17L3-201ENST00000530484 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
USP17L3-201ENST00000530484 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
USP17L3-201ENST00000530484 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.39■□□□□ 0.05
USP17L3-201ENST00000530484 NEFMP07197 916 aa15.38■□□□□ 0.05
USP17L3-201ENST00000530484 PRKAR2BP31323 418 aa15.38■□□□□ 0.05
USP17L3-201ENST00000530484 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP17L3-201ENST00000530484 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP17L3-201ENST00000530484 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms