RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
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TSNARE1-204ENST00000519651 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 ADGRB2O60241 1585 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 DIP2AQ14689 1571 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-204ENST00000519651 PLIN1O60240 522 aa22.96■■□□□ 1.27
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TSNARE1-204ENST00000519651 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.91■■□□□ 1.26
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TSNARE1-204ENST00000519651 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.88■■□□□ 1.25
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TSNARE1-204ENST00000519651 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.88■■□□□ 1.25
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TSNARE1-204ENST00000519651 AKAP12Q02952 1782 aa22.87■■□□□ 1.25
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TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TSNARE1-204ENST00000519651 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.83■■□□□ 1.25
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TSNARE1-204ENST00000519651 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.81■■□□□ 1.24
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TSNARE1-204ENST00000519651 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.75■■□□□ 1.23
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.75■■□□□ 1.23
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TSNARE1-204ENST00000519651 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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TSNARE1-204ENST00000519651 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-204ENST00000519651 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1-204ENST00000519651 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1-204ENST00000519651 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 PDE3AQ14432 1141 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 ABTB2Q8N961 1025 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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