RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 RIPK4P57078 832 aa10.02□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 NME9Q86XW9 330 aa10.02□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.02□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 SLFN5Q08AF3 891 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 NGEFQ8N5V2 710 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM4Q9UKN5 801 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 COG6Q9Y2V7 657 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 LAMC1P11047 1609 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 LTKP29376 864 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 PRKAR2BP31323 418 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 MROH2AA6NES4 1674 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 SYNMO15061 1565 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 AMPHP49418 695 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 GLI2P10070 1586 aa9.99□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 RICTORQ6R327 1708 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 PANK1Q8TE04 598 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 METP08581 1390 aa9.98□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 IQGAP1P46940 1657 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP6P59044 892 aa9.97□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 NSD2O96028 1365 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.96□□□□□ -0.81
TRPS1-208ENST00000519076 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.96□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 SKAP1Q86WV1 359 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-208ENST00000519076 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-208ENST00000519076 ZFYVE9O95405 1425 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ACEP12821 1306 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC11Q96J66 1382 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 POLKQ9UBT6 870 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 PIK3C2BO00750 1634 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 WDR63Q8IWG1 891 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ABTB2Q8N961 1025 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 GSE1Q14687 1217 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRB1O14514 1584 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 PSME1Q06323 249 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 PPLO60437 1756 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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TRPS1-208ENST00000519076 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO3Q9UK99 471 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.92□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ALKQ9UM73 1620 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A1P11836 297 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 AGLP35573 1532 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 DCTN1Q14203 1278 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-208ENST00000519076 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.9□□□□□ -0.82
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