RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	PTPRU	Q92729	1446 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	DIP2A	Q14689	1571 aa		29.93	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	ITSN1	Q15811	1721 aa		29.92	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	29.92	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
PDE4D-223	ENST00000515011	WDR63	Q8IWG1	891 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	TBX22	Q9Y458	520 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	CRBN	Q96SW2	442 aa		29.88	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	PTCH1	Q13635	1447 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	NEUROD2	Q15784	382 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		29.83	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	POLK	Q9UBT6	870 aa		29.83	■■■□□ 2.37
PDE4D-223	ENST00000515011	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PDE4D-223	ENST00000515011	NME9	Q86XW9	330 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PDE4D-223	ENST00000515011	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PDE4D-223	ENST00000515011	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
PDE4D-223	ENST00000515011	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PDE4D-223	ENST00000515011	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PDE4D-223	ENST00000515011	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
PDE4D-223	ENST00000515011	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	COG3	Q96JB2	828 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	BCAR3	O75815	825 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	FBLN1	P23142	703 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	PIK3R4	Q99570	1358 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	FCHSD2	O94868	740 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	USP6	P35125	1406 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	ACE	P12821	1306 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PDE4D-223	ENST00000515011	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	IL16	Q14005	1332 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	IL13	P35225	146 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	SSH2	Q76I76	1423 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	PDE3A	Q14432	1141 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PDE4D-223	ENST00000515011	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	PRKAR2B	P31323	418 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	RIPK4	P57078	832 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	29.61	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		29.61	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.6	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	29.6	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	KCNA6	P17658	529 aa		29.59	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	NEFM	P07197	916 aa		29.58	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		29.58	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	USP31	Q70CQ4	1352 aa		29.58	■■■□□ 2.33
PDE4D-223	ENST00000515011	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		29.57	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.57	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	29.54	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	HMOX1	P09601	288 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	NFE2L2	Q16236	605 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	29.53	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		29.52	■■■□□ 2.32
PDE4D-223	ENST00000515011	PEAK1	Q9H792	1746 aa		29.51	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		29.51	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	MS4A1	P11836	297 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	29.5	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	PANK1	Q8TE04	598 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	29.49	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	PIK3C2A	O00443	1686 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		29.46	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	COG6	Q9Y2V7	657 aa		29.46	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PDE4D-223	ENST00000515011	AAMP	Q13685	434 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PDE4D-223	ENST00000515011	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3

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