RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSME1Q06323 249 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.27■□□□□ 0.2
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP6P35125 1406 aa16.27■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MSH6P52701 1360 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MTHFSP49914 203 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DCCP43146 1447 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STRCQ7RTU9 1775 aa16.26■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM94Q12767 1356 aa16.25■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NGEFQ8N5V2 710 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NME9Q86XW9 330 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEFMP07197 916 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF1AQ12756 1690 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDE3BQ13370 1112 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABTB2Q8N961 1025 aa16.19■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NLRP6P59044 892 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP31Q70CQ4 1352 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SSH2Q76I76 1423 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POLKQ9UBT6 870 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RUNDC1Q96C34 613 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXO3O43524 673 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ORAI2Q96SN7 254 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEFLP07196 543 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MST1RQ04912 1400 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AMPHP49418 695 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FCHSD2O94868 740 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLAIN2Q9P270 581 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SOX12O15370 315 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SBNO1A3KN83 1393 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FLT4P35916 1363 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PIK3C2AO00443 1686 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SHPRHQ149N8 1683 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 USP54Q70EL1 1684 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APAF1O14727 1248 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARHGEF10O15013 1369 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GOLGA2Q08379 1002 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RTL1A6NKG5 1358 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL13P35225 146 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FBLN1P23142 703 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC27Q2M243 656 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BRINP3Q76B58 766 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WDR63Q8IWG1 891 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 E9PSI1 815 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCP02774 474 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEUROD2Q15784 382 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IP6K1Q92551 441 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HOXC9P31274 260 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRKAR2BP31323 418 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms