RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 C6orf229H3BNL8 230 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADB-210ENST00000498648 FBXO45P0C2W1 286 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADB-210ENST00000498648 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
STRADB-210ENST00000498648 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADB-210ENST00000498648 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.28□□□□□ -1.24
STRADB-210ENST00000498648 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 SEC24BO95487 1268 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.27□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 ZBBXA8MT70 800 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 RASA1P20936 1047 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 SCNN1AP37088 669 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.26□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 SLC10A3P09131 477 aa7.25□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 NCOA4Q13772 614 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 PACS2Q86VP3 889 aa7.24□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 SMAPO00193 183 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 NUDT7P0C024 238 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 ASB16Q96NS5 453 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.23□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 H3BRB1 525 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 DPYDQ12882 1025 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 COL19A1Q14993 1142 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 RNF135Q8IUD6 432 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 BCL11AQ9H165 835 aa7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
STRADB-210ENST00000498648 POTEFA5A3E0 1075 aa7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ICMTO60725 284 aa7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ABL1P00519 1130 aa7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 MAPK1P28482 360 aa7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 DESI1Q6ICB0 168 aa7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.21□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 FUT2Q10981 343 aa7.2□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 RETREG3Q86VR2 466 aa7.2□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.2□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.2□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 PTPREP23469 700 aa7.19□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.19□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.19□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.19□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 OGFOD1Q8N543 542 aa7.19□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.19□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 CLDN10P78369 228 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ECM1Q16610 540 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 OCLNQ16625 522 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 LYPD8Q6UX82 237 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 BACH2Q9BYV9 841 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.18□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD62A6NC57 917 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 C21orf2O43822 256 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 PRMT3O60678 531 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 DKK1O94907 266 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 KCNH2Q12809 1159 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 EML3Q32P44 896 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 DPH6Q7L8W6 267 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.17□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ATP6V1AP38606 617 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ATP1A2P50993 1020 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ARSIQ5FYB1 569 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 TRIM50Q86XT4 487 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ZNF592Q92610 1267 aa7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 ARHGAP4P98171 946 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 PROX2Q3B8N5 592 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 SIX5Q8N196 739 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 SLC39A7Q92504 469 aa7.15□□□□□ -1.26
STRADB-210ENST00000498648 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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