RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 PANK3Q9H999 370 aa29.2■■■□□ 2.26
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TTYH3-207ENST00000498454 SSH2Q76I76 1423 aa29.19■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 SBNO1A3KN83 1393 aa29.18■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.16■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.15■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 ALS2Q96Q42 1657 aa29.15■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.14■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.14■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
TTYH3-207ENST00000498454 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.13■■■□□ 2.25
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TTYH3-207ENST00000498454 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
TTYH3-207ENST00000498454 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.11■■■□□ 2.25
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TTYH3-207ENST00000498454 ABTB2Q8N961 1025 aa29.05■■■□□ 2.24
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TTYH3-207ENST00000498454 USP54Q70EL1 1684 aa29.02■■■□□ 2.24
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TTYH3-207ENST00000498454 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.97■■■□□ 2.23
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TTYH3-207ENST00000498454 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.97■■■□□ 2.23
TTYH3-207ENST00000498454 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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TTYH3-207ENST00000498454 SLIT3O75094 1523 aa28.93■■■□□ 2.22
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TTYH3-207ENST00000498454 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.89■■■□□ 2.21
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TTYH3-207ENST00000498454 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.74■■■□□ 2.19
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TTYH3-207ENST00000498454 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.68■■■□□ 2.18
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TTYH3-207ENST00000498454 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.67■■■□□ 2.18
TTYH3-207ENST00000498454 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.67■■■□□ 2.18
TTYH3-207ENST00000498454 ABCC6O95255 1503 aa28.66■■■□□ 2.18
TTYH3-207ENST00000498454 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TTYH3-207ENST00000498454 AMPHP49418 695 aa28.65■■■□□ 2.18
TTYH3-207ENST00000498454 C8orf37Q96NL8 207 aa28.65■■■□□ 2.18
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