RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.54	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	SSH2	Q76I76	1423 aa		12.54	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		12.53	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	COG3	Q96JB2	828 aa		12.53	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.53	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		12.53	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		12.52	□□□□□ -0.4
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.52	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		12.51	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.51	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		12.51	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	ATF3	P18847	181 aa		12.5	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	MTHFS	P49914	203 aa		12.5	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	C14orf37	Q86TY3	774 aa		12.5	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF1A	Q12756	1690 aa		12.49	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	USP54	Q70EL1	1684 aa		12.49	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		12.49	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	MSH6	P52701	1360 aa		12.49	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		12.49	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	MST1R	Q04912	1400 aa		12.48	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM94	Q12767	1356 aa		12.48	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	HSPA2	P54652	639 aa		12.48	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	PSME1	Q06323	249 aa		12.47	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		12.46	□□□□□ -0.41
LPIN3-204	ENST00000496565	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	POLK	Q9UBT6	870 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.45	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	FCHSD2	O94868	740 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	NME9	Q86XW9	330 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	RUNDC1	Q96C34	613 aa		12.44	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.43	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		12.42	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	NEFM	P07197	916 aa		12.42	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.42	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	SBNO1	A3KN83	1393 aa		12.42	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	NUTM2F	A1L443	756 aa		12.41	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.41	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	NLRP6	P59044	892 aa		12.4	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.4	□□□□□ -0.42
LPIN3-204	ENST00000496565	SHPRH	Q149N8	1683 aa		12.39	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		12.39	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	12.38	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		12.38	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	WDR63	Q8IWG1	891 aa		12.38	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	FLT4	P35916	1363 aa		12.38	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	IL13	P35225	146 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	ORAI2	Q96SN7	254 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	PIK3C2A	O00443	1686 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF521	Q96K83	1311 aa		12.37	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	FOXO3	O43524	673 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	GOLGA2	Q08379	1002 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	SLAIN2	Q9P270	581 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	USP19	O94966	1318 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	SLIT3	O75094	1523 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCC6	O95255	1503 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565		E9PSI1	815 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	APAF1	O14727	1248 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	AMPH	P49418	695 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	IL16	Q14005	1332 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LPIN3-204	ENST00000496565	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	NEFL	P07196	543 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	IP6K1	Q92551	441 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
LPIN3-204	ENST00000496565	GC	P02774	474 aa		12.31	□□□□□ -0.44

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