RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERCC3-208	ENST00000491292	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERCC3-208	ENST00000491292	NUCB1	Q02818	461 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERCC3-208	ENST00000491292	RABEP1	Q15276	862 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERCC3-208	ENST00000491292	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
ERCC3-208	ENST00000491292	IGSF3	O75054	1194 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	PIK3C2G	O75747	1445 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	DTNB	O60941	627 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	SPC24	Q8NBT2	197 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	MCC	P23508	829 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	SNX21	Q969T3	373 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP7D2	Q96T17	732 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	GCC1	Q96CN9	775 aa		12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	DCTN1	Q14203	1278 aa		12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	REC8	O95072	547 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	INSR	P06213	1382 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	USP25	Q9UHP3	1055 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	NUTM2F	A1L443	756 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	FIBP	O43427	364 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP10B	O94823	1461 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNJ4	P48050	445 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	PLA2R1	Q13018	1463 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	PHF14	O94880	888 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA0556	O60303	1618 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	MBD3	O95983	291 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	GNAI1	P63096	354 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	HMMR	O75330	724 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	NPHP1	O15259	732 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	SDS	P20132	328 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	ERC2	O15083	957 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
ERCC3-208	ENST00000491292	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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