RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490047.1

CEP350-208, Transcript of centrosomal protein 350, human

TSL 3

Gene CEP350, Length 434 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP350-208	ENST00000490047	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	SPTLC1	O15269	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	CTH	P32929	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	NNT	Q13423	1086 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	TRIM66	O15016	1216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	HRC	P23327	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047		H3BM21	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	ADH1C	P00326	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	TIMP2	P16035	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	GMPR	P36959	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	SCARF1	Q14162	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	IRF7	Q92985	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	AK7	Q96M32	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CEP350-208	ENST00000490047	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	VEGFB	P49765	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	NR3C2	P08235	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	NR5A1	Q13285	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	QPCT	Q16769	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	LILRB3	O75022	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	GRM5	P41594	1212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	AGER	Q15109	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	TSC1	Q92574	1164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	SOBP	A7XYQ1	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	SLC24A1	O60721	1099 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	PDE4D	Q08499	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	MAN1A2	O60476	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	FSHR	P23945	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	UPP2	O95045	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP350-208	ENST00000490047	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	BMP2	P12643	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CEP350-208	ENST00000490047	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64

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