RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483995.1

PTPRZ1-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRZ1, Length 817 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-208ENST00000483995 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 CTHP32929 405 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 BMP1P13497 986 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 KIFC2Q96AC6 838 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 MAP10Q9P2G4 905 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 LCE2CQ5TA81 110 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRZ1-208ENST00000483995 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 QPCTQ16769 361 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 MPNDQ8N594 471 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 FOXJ1Q92949 421 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 LILRB3O75022 631 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 NNTQ13423 1086 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRZ1-208ENST00000483995 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 FAM174AQ8TBP5 190 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 TSC1Q92574 1164 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 WIPF1O43516 503 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 CDK15Q96Q40 435 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 ADH1CP00326 375 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 TIMP2P16035 220 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 ZFP42Q96MM3 310 aa11.86□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 ARID5BQ14865 1188 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRZ1-208ENST00000483995 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 AGERQ15109 404 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 NR3C2P08235 984 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 GRM5P41594 1212 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 NR5A1Q13285 461 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 ITPKCQ96DU7 683 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRZ1-208ENST00000483995 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 VEGFBP49765 207 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 SCARF1Q14162 830 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 NBPF14Q5TI25 921 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 H3BM21 787 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 STK17AQ9UEE5 414 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 SOBPA7XYQ1 873 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 GMPRP36959 345 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 ERBB4Q15303 1308 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRZ1-208ENST00000483995 FSHRP23945 695 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 IRF7Q92985 503 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 FAM117AQ9C073 453 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 ERFEQ4G0M1 354 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 MEIOBQ8N635 442 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 LORP23490 312 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRZ1-208ENST00000483995 BMP2P12643 396 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-208ENST00000483995 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-208ENST00000483995 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRZ1-208ENST00000483995 MAN1A2O60476 641 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-208ENST00000483995 NR6A1Q15406 480 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRZ1-208ENST00000483995 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms