RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482320.5

TNPO3-204, Transcript of transportin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNPO3, Length 3,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO3-204	ENST00000482320	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71	1e-6	■■■□□ 16.7
TNPO3-204	ENST00000482320	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	CABP1	Q9NZU7	370 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	C3	P01024	1663 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	BACH2	Q9BYV9	841 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	ATF3	P18847	181 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	ZFYVE9	O95405	1425 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TNPO3-204	ENST00000482320	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		10.58	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	MS4A1	P11836	297 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	MORC1	Q86VD1	984 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		10.57	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	ALK	Q9UM73	1620 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		10.56	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		10.55	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		10.55	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		10.55	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	PSME1	Q06323	249 aa		10.55	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		10.55	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		10.54	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	MED14	O60244	1454 aa		10.54	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	FOXO3	O43524	673 aa		10.54	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	DLC1	Q96QB1	1528 aa		10.54	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	CRBN	Q96SW2	442 aa		10.52	□□□□□ -0.72
TNPO3-204	ENST00000482320	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PEAK1	Q9H792	1746 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PIP4K2B	P78356	416 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ORAI2	Q96SN7	254 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	TMEM94	Q12767	1356 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ABCC6	O95255	1503 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PANK2	Q9BZ23	570 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PTPRU	Q92729	1446 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ACE	P12821	1306 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	NLRP6	P59044	892 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	RALBP1	Q15311	655 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ABTB2	Q8N961	1025 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	SLIT1	O75093	1534 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	COG3	Q96JB2	828 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	FBLN1	P23142	703 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	MSH6	P52701	1360 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	NME9	Q86XW9	330 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PIK3R4	Q99570	1358 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	CFAP53	Q96M91	514 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TNPO3-204	ENST00000482320	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		10.46	□□□□□ -0.74

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