RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.5■□□□□ 0.55
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 USP21Q9UK80 565 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RGS12O14924 1447 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SBNO1A3KN83 1393 aa18.2■□□□□ 0.5
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NEFMP07197 916 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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HOXB-AS3-209ENST00000477144 RUNDC1Q96C34 613 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SLIT3O75094 1523 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.14■□□□□ 0.49
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