RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.85■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.85■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 ALS2Q96Q42 1657 aa18.85■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 ACEP12821 1306 aa18.84■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.84■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 CABP2Q9NPB3 220 aa18.84■□□□□ 0.61
PRAME-211ENST00000476336 ATRNO75882 1429 aa18.83■□□□□ 0.6
PRAME-211ENST00000476336 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PRAME-211ENST00000476336 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
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PRAME-211ENST00000476336 AKAP12Q02952 1782 aa18.74■□□□□ 0.59
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PRAME-211ENST00000476336 ABTB2Q8N961 1025 aa18.74■□□□□ 0.59
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PRAME-211ENST00000476336 TESK2Q96S53 571 aa18.73■□□□□ 0.59
PRAME-211ENST00000476336 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.73■□□□□ 0.59
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PRAME-211ENST00000476336 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.65■□□□□ 0.58
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PRAME-211ENST00000476336 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.64■□□□□ 0.57
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PRAME-211ENST00000476336 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.62■□□□□ 0.57
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PRAME-211ENST00000476336 KIAA0232Q92628 1395 aa18.62■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 SLIT3O75094 1523 aa18.61■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.61■□□□□ 0.57
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PRAME-211ENST00000476336 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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PRAME-211ENST00000476336 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.6■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 USP54Q70EL1 1684 aa18.6■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PP64 1363 aa18.59■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 USP31Q70CQ4 1352 aa18.58■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.58■□□□□ 0.57
PRAME-211ENST00000476336 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 EVA1CP58658 441 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 CHRNA2Q15822 529 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 ABCC6O95255 1503 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PRAME-211ENST00000476336 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 NME9Q86XW9 330 aa18.5■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 STRN4Q9NRL3 753 aa18.5■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 NFAT5O94916 1531 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 DEFB132Q7Z7B7 95 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 COG3Q96JB2 828 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-211ENST00000476336 MYOM1P52179 1685 aa18.49■□□□□ 0.55
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