RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HPS1-208ENST00000467246 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-208ENST00000467246 SIRT1Q96EB6 747 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-208ENST00000467246 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-208ENST00000467246 TECPR2O15040 1411 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-208ENST00000467246 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-208ENST00000467246 POLKQ9UBT6 870 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-208ENST00000467246 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 NME9Q86XW9 330 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 ADGRB2O60241 1585 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 PANK1Q8TE04 598 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 PDE3AQ14432 1141 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 PDE4AP27815 886 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 CPS1P31327 1500 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 MS4A1P11836 297 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 COG6Q9Y2V7 657 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 NUTM2FA1L443 756 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 RIPK4P57078 832 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 TNNQ9UQP3 1299 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 BACH2Q9BYV9 841 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-208ENST00000467246 FCHSD2O94868 740 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 EID1Q9Y6B2 187 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.77□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 PTPRUQ92729 1446 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 HMOX1P09601 288 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 RLBP1P12271 317 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 PRKAR2BP31323 418 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 COG3Q96JB2 828 aa14.76□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 IGHDP01880 384 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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HPS1-208ENST00000467246 C3P01024 1663 aa14.75□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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HPS1-208ENST00000467246 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.74□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 IL13P35225 146 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.73□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 ACEP12821 1306 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 IL16Q14005 1332 aa14.72□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 SLIT1O75093 1534 aa14.71□□□□□ -0.05
HPS1-208ENST00000467246 RGS3P49796 1198 aa14.71□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.71□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 TBX22Q9Y458 520 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 AKAP12Q02952 1782 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 NEFMP07197 916 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.7□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.69□□□□□ -0.06
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HPS1-208ENST00000467246 ITSN1Q15811 1721 aa14.69□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 NFE2L2Q16236 605 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.68□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.67□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HPS1-208ENST00000467246 USP6P35125 1406 aa14.66□□□□□ -0.06
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