RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.45■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 CABP1Q9NZU7 370 aa23.43■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP1Q9C000 1473 aa23.42■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.4■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 RIPK4P57078 832 aa23.39■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 IL16Q14005 1332 aa23.39■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.38■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.37■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 NFKBIBQ15653 356 aa23.37■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.37■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 ZMYM3Q14202 1370 aa23.36■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.34■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 USP19O94966 1318 aa23.34■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM27P14373 513 aa23.34■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 SEC24BO95487 1268 aa23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 FCHSD2O94868 740 aa23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.33■■□□□ 1.33
SYNE4-204ENST00000465425 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 DLC1Q96QB1 1528 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.32■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 AGLP35573 1532 aa23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 ATP7BP35670 1465 aa23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 REREQ9P2R6 1566 aa23.31■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 KIF16BQ96L93 1317 aa23.3■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 BECN1Q14457 450 aa23.3■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 DIP2BQ9P265 1576 aa23.29■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 MLECQ14165 292 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 POLKQ9UBT6 870 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 PRKAR2BP31323 418 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.28■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 TSPOAP1O95153 1857 aa23.27■■□□□ 1.32
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.26■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.26■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.26■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 FBLN1P23142 703 aa23.26■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.24■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.24■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.24■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 GSE1Q14687 1217 aa23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 HMOX1P09601 288 aa23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.22■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.21■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF428Q96B54 188 aa23.21■■□□□ 1.31
SYNE4-204ENST00000465425 NFE2L2Q16236 605 aa23.2■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.2■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.19■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.18■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 NME9Q86XW9 330 aa23.18■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.18■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 METP08581 1390 aa23.17■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 SMC5Q8IY18 1101 aa23.16■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 COG3Q96JB2 828 aa23.16■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 IL13P35225 146 aa23.15■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 GNAI1P63096 354 aa23.15■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.15■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SYNE4-204ENST00000465425 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.14■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.13■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 IFT57Q9NWB7 429 aa23.13■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.12■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.12■■□□□ 1.29
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