RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.88■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.88■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.87■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COG3Q96JB2 828 aa22.86■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLFN5Q08AF3 891 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.85■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 E9PSI1 815 aa22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NME9Q86XW9 330 aa22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.84■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNA6P17658 529 aa22.83■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ACEP12821 1306 aa22.83■■□□□ 1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP6P35125 1406 aa22.83■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.82■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.82■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUTM2FA1L443 756 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC27Q2M243 656 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WWC1Q8IX03 1113 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POLKQ9UBT6 870 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.8■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.78■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.77■■□□□ 1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR63Q8IWG1 891 aa22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEUROD2Q15784 382 aa22.75■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.75■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.75■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SSH2Q76I76 1423 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.74■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEFMP07197 916 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.72■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FCHSD2O94868 740 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NWD1Q149M9 1564 aa22.71■■□□□ 1.23
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.7■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBLN1P23142 703 aa22.69■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.69■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.69■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP31Q70CQ4 1352 aa22.68■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.67■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IL13P35225 146 aa22.66■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIK3C2AO00443 1686 aa22.65■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.64■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP54Q70EL1 1684 aa22.64■■□□□ 1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLIN1O60240 522 aa22.63■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRKAR2BP31323 418 aa22.63■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IL16Q14005 1332 aa22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIPK4P57078 832 aa22.61■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C14orf37Q86TY3 774 aa22.6■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.6■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.6■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PEAK1Q9H792 1746 aa22.59■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.59■■□□□ 1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMOX1P09601 288 aa22.58■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CRBNQ96SW2 442 aa22.57■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NFE2L2Q16236 605 aa22.56■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SBNO1A3KN83 1393 aa22.56■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FLT4P35916 1363 aa22.55■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NLRP6P59044 892 aa22.55■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.54■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCAR3O75815 825 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.53■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SOX12O15370 315 aa22.52■■□□□ 1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.52■■□□□ 1.2
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