RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NEK1-201ENST00000439128 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.65□□□□□ -0.06
NEK1-201ENST00000439128 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 12.4
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NEK1-201ENST00000439128 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.64□□□□□ -0.07
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NEK1-201ENST00000439128 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.64□□□□□ -0.07
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NEK1-201ENST00000439128 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.63□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.076e-7■□□□□ 8.9
NEK1-201ENST00000439128 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.63□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 ASXL2Q76L83 1435 aa14.63□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 XBP1P17861 261 aa14.63□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.62□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 RFC4P35249 363 aa14.62□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NEK1-201ENST00000439128 NME9Q86XW9 330 aa14.62□□□□□ -0.07
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