RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434353.6

CXorf40A-208, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-208ENST00000434353 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.05■■□□□ 1.76
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CXorf40A-208ENST00000434353 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.05■■□□□ 1.76
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CXorf40A-208ENST00000434353 SSH2Q76I76 1423 aa26.03■■□□□ 1.76
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CXorf40A-208ENST00000434353 NLRP13Q86W25 1043 aa25.9■■□□□ 1.74
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CXorf40A-208ENST00000434353 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
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CXorf40A-208ENST00000434353 USP19O94966 1318 aa25.85■■□□□ 1.73
CXorf40A-208ENST00000434353 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.85■■□□□ 1.73
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CXorf40A-208ENST00000434353 SLIT3O75094 1523 aa25.81■■□□□ 1.72
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CXorf40A-208ENST00000434353 NFAT5O94916 1531 aa25.74■■□□□ 1.71
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CXorf40A-208ENST00000434353 CHRNA2Q15822 529 aa25.68■■□□□ 1.7
CXorf40A-208ENST00000434353 LTN1O94822 1766 aa25.67■■□□□ 1.7
CXorf40A-208ENST00000434353 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
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CXorf40A-208ENST00000434353 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.66■■□□□ 1.7
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CXorf40A-208ENST00000434353 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.64■■□□□ 1.7
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CXorf40A-208ENST00000434353 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.62■■□□□ 1.69
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CXorf40A-208ENST00000434353 AMPHP49418 695 aa25.6■■□□□ 1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.6■■□□□ 1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.6■■□□□ 1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 POLKQ9UBT6 870 aa25.59■■□□□ 1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 COL18A1P39060 1754 aa25.59■■□□□ 1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 BTG4Q9NY30 223 aa25.58■■□□□ 1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 PEAK1Q9H792 1746 aa25.58■■□□□ 1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 SLIT2O94813 1529 aa25.58■■□□□ 1.68
CXorf40A-208ENST00000434353 AFF2P51816 1311 aa25.58■■□□□ 1.68
CXorf40A-208ENST00000434353 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.57■■□□□ 1.68
CXorf40A-208ENST00000434353 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.57■■□□□ 1.68
CXorf40A-208ENST00000434353 ABCC6O95255 1503 aa25.56■■□□□ 1.68
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