RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 STK26Q9P289 416 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC27Q2M243 656 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP53Q96M91 514 aa23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.24■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FSD2A1L4K1 749 aa23.23■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.23■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.23■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 USP32Q8NFA0 1604 aa23.22■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM4P33991 863 aa23.22■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RALGPS1-208ENST00000424082 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.2■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.2■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.2■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ARXQ96QS3 562 aa23.2■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.17■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CABP2Q9NPB3 220 aa23.16■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.16■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRB2O60241 1585 aa23.15■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 PANK2Q9BZ23 570 aa23.15■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.15■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 ALKQ9UM73 1620 aa23.15■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.14■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 EVC2Q86UK5 1308 aa23.14■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.14■■□□□ 1.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM27P14373 513 aa23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PRAM1Q96QH2 718 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCN1P35523 988 aa23.13■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRMP28827 1452 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NSD2O96028 1365 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAK2O60296 914 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.12■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.1■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 MRE11P49959 708 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-208ENST00000424082 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PP64 1363 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 TNRQ92752 1358 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC11Q96J66 1382 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 SMC5Q8IY18 1101 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-208ENST00000424082 HSCBQ8IWL3 235 aa23.01■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.01■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.01■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 RIPK4P57078 832 aa23■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 METP08581 1390 aa23■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK19Q9BWU1 502 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 FYB1O15117 783 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 DDIT3P35638 169 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 IL16Q14005 1332 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 LNPKQ9C0E8 428 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF16BQ96L93 1317 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 ESPNB1AK53 854 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 NUCB1Q02818 461 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX21Q969T3 373 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms