RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423456.5

MEG3-206, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MEG3, Length 1,771 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-206ENST00000423456 E9PSI1 815 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-206ENST00000423456 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MEG3-206ENST00000423456 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
MEG3-206ENST00000423456 WWC1Q8IX03 1113 aa22.08■■□□□ 1.13
MEG3-206ENST00000423456 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MEG3-206ENST00000423456 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.08■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.08■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 CCDC27Q2M243 656 aa22.07■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.07■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 PIK3R4Q99570 1358 aa22.07■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.07■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 ITSN1Q15811 1721 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.04■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.04■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 POLKQ9UBT6 870 aa22.04■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.03■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 NME9Q86XW9 330 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 WDR63Q8IWG1 891 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-206ENST00000423456 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 EXOC6Q8TAG9 804 aa22■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 PLIN1O60240 522 aa21.98■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 ACEP12821 1306 aa21.98■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.98■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.98■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.97■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 COG3Q96JB2 828 aa21.97■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 SSH2Q76I76 1423 aa21.97■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.97■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 FBLN1P23142 703 aa21.97■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 USP6P35125 1406 aa21.96■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 NEUROD2Q15784 382 aa21.96■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
MEG3-206ENST00000423456 KCNA6P17658 529 aa21.95■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 FCHSD2O94868 740 aa21.93■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.92■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.92■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.92■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.92■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 NUTM2FA1L443 756 aa21.91■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 IL13P35225 146 aa21.91■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 CRBNQ96SW2 442 aa21.91■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.9■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.89■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.89■■□□□ 1.1
MEG3-206ENST00000423456 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.89■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.88■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 USP31Q70CQ4 1352 aa21.88■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.88■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.87■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.87■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.87■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 IL16Q14005 1332 aa21.86■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 BCAR3O75815 825 aa21.86■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.84■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 PRKAR2BP31323 418 aa21.83■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
MEG3-206ENST00000423456 RIPK4P57078 832 aa21.82■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 PDE3AQ14432 1141 aa21.79■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 NFE2L2Q16236 605 aa21.79■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.78■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.78■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 NEFMP07197 916 aa21.77■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 HMOX1P09601 288 aa21.77■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 PEAK1Q9H792 1746 aa21.77■■□□□ 1.08
MEG3-206ENST00000423456 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.76■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 PIK3C2AO00443 1686 aa21.76■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 USP54Q70EL1 1684 aa21.76■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 NWD1Q149M9 1564 aa21.74■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.72■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.72■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.71■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.71■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.71■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 SBNO1A3KN83 1393 aa21.71■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
MEG3-206ENST00000423456 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms