RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 RLBP1P12271 317 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 GSE1Q14687 1217 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 C3P01024 1663 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC24BO95487 1268 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR63Q8IWG1 891 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1-202ENST00000417536 USP19O94966 1318 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.424e-6■■■■□ 20.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CABP1Q9NZU7 370 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PP64 1363 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 FBLN1P23142 703 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 USP32Q8NFA0 1604 aa23.89■■□□□ 1.42
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC27Q2M243 656 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 AAMPQ13685 434 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SH3BP1-202ENST00000417536 NSD2O96028 1365 aa23.83■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 EID1Q9Y6B2 187 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP1Q9C000 1473 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 BECN1Q14457 450 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC11Q96J66 1382 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FYB1O15117 783 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRB2O60241 1585 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRUQ92729 1446 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM27P14373 513 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NME9Q86XW9 330 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.7■■□□□ 1.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DLC1Q96QB1 1528 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX12O15370 315 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 RIPK4P57078 832 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNA6P17658 529 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1-202ENST00000417536 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 CPS1P31327 1500 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1-202ENST00000417536 SLIT1O75093 1534 aa23.61■■□□□ 1.37
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