RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 TMF1P82094 1093 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 JCADQ9P266 1359 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 CDCA8Q53HL2 280 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 TESK2Q96S53 571 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 PIP4P2Q8N4L2 257 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS1-205ENST00000414009 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 CABP1Q9NZU7 370 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 PXDNQ92626 1479 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 ACEP12821 1306 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 TMC1Q8TDI8 760 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 SHPRHQ149N8 1683 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 SBNO1A3KN83 1393 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-205ENST00000414009 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 ARHGEF10O15013 1369 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HPS1-205ENST00000414009 USP6P35125 1406 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 PLEKHG5O94827 1062 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 ABTB2Q8N961 1025 aa20.43■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 AKAP12Q02952 1782 aa20.43■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 ALS2Q96Q42 1657 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS1-205ENST00000414009 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 ADAMTS2O95450 1211 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 NLRP13Q86W25 1043 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 A0A1W2PP64 1363 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 LRP6O75581 1613 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 NLRP6P59044 892 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 C8orf37Q96NL8 207 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 NGLY1Q96IV0 654 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 SSH2Q76I76 1423 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS1-205ENST00000414009 MYOM1P52179 1685 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 ABCA3Q99758 1704 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 PIK3C2AO00443 1686 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 USP19O94966 1318 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 NME9Q86XW9 330 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 AFF2P51816 1311 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 CCDC7Q96M83 1385 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 GCP02774 474 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS1-205ENST00000414009 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 COG3Q96JB2 828 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 PANK3Q9H999 370 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 USP31Q70CQ4 1352 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 SOX12O15370 315 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 USP21Q9UK80 565 aa20.24■□□□□ 0.83
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