RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
SH3BP5-204ENST00000412806 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP5-204ENST00000412806 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP5-204ENST00000412806 ACEP12821 1306 aa28.51■■■□□ 2.16
SH3BP5-204ENST00000412806 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 RUNDC1Q96C34 613 aa28.5■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA2Q08379 1002 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 FBLN1P23142 703 aa28.48■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 USP6P35125 1406 aa28.47■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 NGEFQ8N5V2 710 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 POLKQ9UBT6 870 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP5-204ENST00000412806 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 COG3Q96JB2 828 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 SLFN5Q08AF3 891 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 SSH2Q76I76 1423 aa28.4■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
SH3BP5-204ENST00000412806 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 WWC1Q8IX03 1113 aa28.39■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.39■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.39■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 NEUROD2Q15784 382 aa28.37■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 NWD1Q149M9 1564 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 E9PSI1 815 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP5-204ENST00000412806 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 PIK3C2AO00443 1686 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.31■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.31■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC27Q2M243 656 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 PEAK1Q9H792 1746 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 USP31Q70CQ4 1352 aa28.26■■■□□ 2.12
SH3BP5-204ENST00000412806 IL13P35225 146 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR63Q8IWG1 891 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 USP54Q70EL1 1684 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 PLIN1O60240 522 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 FCHSD2O94868 740 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.2■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.2■■■□□ 2.11
SH3BP5-204ENST00000412806 PRKAR2BP31323 418 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 HMOX1P09601 288 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 C14orf37Q86TY3 774 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 SOX12O15370 315 aa28.17■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 RIPK4P57078 832 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPA2P54652 639 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP6P59044 892 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 NEFMP07197 916 aa28.11■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.11■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.1■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 BCAR3O75815 825 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 ABTB2Q8N961 1025 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 CRBNQ96SW2 442 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP5-204ENST00000412806 SBNO1A3KN83 1393 aa28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms