RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 PTCH1Q13635 1447 aa27.7■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 DIP2AQ14689 1571 aa27.69■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.69■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.69■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.68■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.68■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 ADGRB2O60241 1585 aa27.67■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 POLKQ9UBT6 870 aa27.67■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.66■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 GOLGA2Q08379 1002 aa27.66■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.65■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.65■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.65■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 RUNDC1Q96C34 613 aa27.65■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.65■■■□□ 2.02
C10orf55-202ENST00000412307 COG3Q96JB2 828 aa27.63■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.63■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.62■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 PIK3R4Q99570 1358 aa27.61■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 SLFN5Q08AF3 891 aa27.6■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.6■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 AKAP12Q02952 1782 aa27.59■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 ITSN1Q15811 1721 aa27.59■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 WWC1Q8IX03 1113 aa27.59■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 SOX12O15370 315 aa27.58■■■□□ 2.01
C10orf55-202ENST00000412307 PLIN1O60240 522 aa27.57■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.57■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.56■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 USP6P35125 1406 aa27.55■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.53■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
C10orf55-202ENST00000412307 HSPA2P54652 639 aa27.51■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 C14orf37Q86TY3 774 aa27.5■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.5■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 HMOX1P09601 288 aa27.5■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.49■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 E9PSI1 815 aa27.47■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 SSH2Q76I76 1423 aa27.47■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.47■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.46■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.46■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 IL13P35225 146 aa27.45■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
C10orf55-202ENST00000412307 NGEFQ8N5V2 710 aa27.45■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.44■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.43■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 PRKAR2BP31323 418 aa27.43■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.42■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.42■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.42■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.42■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.42■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.42■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.41■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.41■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.41■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.41■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.4■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.4■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 FCHSD2O94868 740 aa27.4■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 NLRP6P59044 892 aa27.4■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.4■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 RIPK4P57078 832 aa27.39■■□□□ 1.98
C10orf55-202ENST00000412307 BCAR3O75815 825 aa27.38■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC27Q2M243 656 aa27.38■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.38■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 ORAI2Q96SN7 254 aa27.38■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 WDR63Q8IWG1 891 aa27.37■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.37■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 ABTB2Q8N961 1025 aa27.36■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.34■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 USP31Q70CQ4 1352 aa27.34■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.34■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 PLEKHG5O94827 1062 aa27.34■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.33■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
C10orf55-202ENST00000412307 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.33■■□□□ 1.96
C10orf55-202ENST00000412307 CRBNQ96SW2 442 aa27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms