RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKAP12Q02952 1782 aa12.09□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACEP12821 1306 aa12.09□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP47Q96K76 1375 aa12.08□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP6P35125 1406 aa12.07□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AFF2P51816 1311 aa12.07□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDCA8Q53HL2 280 aa12.06□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NGLY1Q96IV0 654 aa12.06□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.05□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ILDR2Q71H61 639 aa12.05□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOCS7O14512 581 aa12.04□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTS2O95450 1211 aa12.04□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNA4P22459 653 aa12.04□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.04□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC21AQ8NDW8 1320 aa12.04□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP54Q70EL1 1684 aa12.03□□□□□ -0.48
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SSH2Q76I76 1423 aa12.03□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TESK2Q96S53 571 aa12.03□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP19O94966 1318 aa12.03□□□□□ -0.48
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.97□□□□□ -0.49
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.97□□□□□ -0.49
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.97□□□□□ -0.49
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1W2PP64 1363 aa11.96□□□□□ -0.49
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS72Q15906 364 aa11.96□□□□□ -0.49
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMC1Q8TDI8 760 aa11.96□□□□□ -0.49
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYOM1P52179 1685 aa11.95□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCP02774 474 aa11.95□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRP6P59044 892 aa11.95□□□□□ -0.5
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGS12O14924 1447 aa11.94□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLI3P10071 1580 aa11.94□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM83GA6ND36 823 aa11.94□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.93□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.93□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.93□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.93□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.92□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFAT5O94916 1531 aa11.92□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTG4Q9NY30 223 aa11.92□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.9□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL18A1P39060 1754 aa11.9□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.9□□□□□ -0.5
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.89□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.89□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.89□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.89□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LTN1O94822 1766 aa11.89□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHG5O94827 1062 aa11.88□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.88□□□□□ -0.51
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